Исследователи Юго-Западного медицинского центра Техасского университета выявили сотни новых генетических вариантов в разнообразной по происхождению когорте из 195 семей, включая 222 человека с расстройством аутистического спектра (РАС), что расширило каталог известных мутаций, связанных с РАС. Уникальные варианты еще не были зарегистрированы ни в каких геномных данных из общедоступных баз данных, и не присутствовали ни у одного другого человека в когорте.

В исследовании, опубликованном в npj Genomic Medicine , исследователи также сообщили об обнаружении потенциально патогенных вариантов, которые могут увеличить риск развития аутизма, в 73 известных генах РАС или расстройства нейроразвития, обнаруженных у 69 людей с РАС. Кроме того, группа обнаружила потенциально патогенные варианты в 120 новых генах-кандидатах, которые требуют дальнейших исследований для подтверждения их роли в РАС.

«Исследования показывают, что с восприимчивостью к РАС может быть связано до 1000 генов, а генетические варианты, выявленные на сегодняшний день, представляют собой лишь часть бремени заболевания», — говорит старший автор Мария Чахрур, доктор философии, доцент Центра роста и развития человека имени Юджина Макдермотта, Центра генетики защиты организма, нейронауки и психиатрии.

«Нам предстоит пройти долгий путь, чтобы полностью понять конкретные генетические причины РАС, но исследования, подобные этому, расширяют наши знания, позволяют нам точнее направлять будущие исследования и в конечном итоге могут привести к разработке целенаправленной терапии».

Для выявления этих мутаций и вариантов исследователи использовали метод изучения редких генетических заболеваний, называемый секвенированием всего экзома . Этот процесс включает анализ кодирующих белок областей генов в геноме, известном как экзом, который составляет около 1% генома, но содержит 85% известных вариантов, связанных с заболеваниями.

Полное секвенирование экзома быстрее и менее затратно, чем полное секвенирование генома. Для получения ДНК используются кровь, слюна или мазки со щеки. Секвенирование проводилось в сотрудничестве с Regeneron Genetics Center.

Исследование основано на предыдущей работе Юго-Западного университета Техаса по изучению генетической основы РАС в различных популяциях, включая новаторское исследование когорты лиц восточноафриканского происхождения, у которых распространенность этого состояния выше, чем у других популяций. Семьи, включенные в текущее исследование, которые в основном были из района Даллас-Форт-Уэрт и включали некоторых пациентов из Детского медицинского центра Далласа, представляли афроамериканское, азиатское, латиноамериканское, ближневосточное, индейское и европейское происхождение.

«Сосредоточение внимания на разнообразной, многородственной когорте, как мы сделали в этом последнем исследовании, помогает выявить специфические для предков эффекты и улучшить интерпретацию данных клинического генетического тестирования, поскольку мы работаем над раскрытием генетических основ этого состояния», — сказал доктор Чахрур, исследователь в Институте мозга Питера О\’Доннелла-младшего.

«В прошлом генетические исследования РАС были сосредоточены почти исключительно на популяциях европейского происхождения, а наша цель — расширить генетический ландшафт РАС среди различных предков, особенно тех, которые недостаточно представлены».