Ученые из Детской исследовательской больницы Св. Иуды, Детской больницы Сиэтла и Детской онкологической группы (COG) выявили новые генетические вариации, которые влияют на риск рецидива у детей со стандартным риском острого В-клеточного лимфобластного лейкоза (SR B-ALL), наиболее распространенного детского рака.

Идентификация геномных предикторов рецидива при SR B-ALL обеспечивает основу для улучшенной диагностики, точного подбора интенсивности лечения и потенциальной разработки новых подходов к лечению. Исследование было опубликовано сегодня в Journal of Clinical Oncology .

Стандартный риск ОЛЛ имеет отличный прогноз с частотой ремиссии более 90%. Однако около 15% пациентов, достигших ремиссии, впоследствии переживают рецидив.

Предыдущие исследования, изучающие геномные изменения для прогнозирования риска рецидива, в основном были сосредоточены на подгруппах ОЛЛ с высоким риском. SR B-ОЛЛ представляет собой большую группу пациентов и составляет примерно половину детей с ОЛЛ, у которых происходит рецидив.

Это исследование является одним из первых, в котором систематически в больших масштабах изучаются генетические факторы, влияющие на риск рецидива при SR B-ОЛЛ.

«ОЛЛ, как наиболее распространенный вид детского рака, является большой историей успеха, поскольку более 90% детей излечиваются. Но остается группа детей, чья болезнь не излечивается полностью, и мы не до конца понимаем, почему это так», — сказал соавтор Чарльз Маллиган, бакалавр медицины и хирургии (с отличием), магистр наук, доктор медицины, заместитель директора Центра комплексного лечения онкологических заболеваний Св. Иуды и сотрудник отделения патологии.

«Это исследование было сосредоточено на той группе плохо изученных случаев, где мы меньше знаем о признаках, которые влияют на риск неэффективности лечения и рецидива болезни».

Выявление генетических вариаций, модулирующих риск
Геномное профилирование выявляет специфические генетические изменения, связанные с восприимчивостью к раку, риском рецидива и тем, как опухоли реагируют на терапию. Эти исследования позволяют ученым и врачам предсказывать, как пациенты, скорее всего, отреагируют на терапию, предоставляя информацию, которая формирует лечение детского ОЛЛ.

Результаты этого совместного исследования демонстрируют важность геномного профилирования для точного определения риска развития у пациента В-ОЛЛ в сочетании с традиционными критериями.

«В будущем мы планируем сократить использование традиционных методов лечения для детей с острым лимфобластным лейкозом, поскольку знаем, что многих пациентов можно вылечить с помощью меньшего количества терапии», — пояснила соавтор, доктор медицины Миньон Ло, руководитель Детского центра рака и заболеваний крови в Сиэтле.

«Мы хотим быть уверены в том, что точно идентифицируем этих детей, и благодаря особому дизайну исследования этот проект позволил нам сделать именно это».

Лох — почетный председатель комитета COG ALL, директор Детского центра исследований рака у детей имени Бена Тауна в Сиэтле и руководитель Детского отделения гематологии, онкологии, трансплантации костного мозга и клеточной терапии в Сиэтле.

Ученые провели секвенирование генома и транскриптома как на образцах SR B-ALL, которые рецидивировали, так и на образцах, которые оставались в полной ремиссии в соотношении один к двум. Они обнаружили, что подтипы ALL, генетические изменения и паттерны анеуплоидии (лишние или отсутствующие хромосомы) были связаны с риском рецидива и временем до рецидива.

Некоторые подтипы B-ОЛЛ, такие как гипердиплоидный и ETV6::RUNX1 ОЛЛ, имели низкую частоту рецидивов, но другие, включая PAX5-измененный, TCF3/4::HLF, ETV6::RUNX1-подобный и BCR::ABL1-подобный, были связаны с повышенным риском рецидива.

Примечательно, что конкретный тип генетических изменений в пределах этих подтипов B-ALL дополнительно влиял на риск рецидива. Эта работа продемонстрировала, что генетические вариации и подтипы рака влияют на риск рецидива при SR B-ALL, и пациенты, отнесенные к стандартному риску, могут иметь опухоли с признаками высокого риска.

«Полногеномное секвенирование имело важное значение для точного и всестороннего выявления этих изменений, и без него их невозможно было бы выявить», — пояснил Маллиган.

«У детей с ОЛЛ с рецидивирующим синдромом после первичной диагностики необходимо провести секвенирование генома опухолевых клеток, чтобы определить, имеют ли их опухолевые клетки эти признаки высокого риска, и таким образом можно повысить интенсивность их первоначальной терапии».

«Помимо традиционных методов лечения, эта информация может быть использована для разработки и изучения новых, персонализированных стратегий лечения», — добавил Лох.