Крупнейшая в мире база данных химерных генов обещает персонализированную терапию рака
Новое исследование, проведенное в Институте синтетической биологии имени Скоена при Медицинской школе Дины Реканати при Университете Райхмана, объявляет о запуске базы данных ChiTaRS 8.0 — крупнейшей в мире коллекции химерных генов (слияний генов), обнаруженных у людей с раком и другими хроническими заболеваниями.
Проект, возглавляемый доктором Миланой Френкель-Моргенштерн, главой лаборатории геномики и вычислительной биологии, совместно с докторантами Диланом Д'Суза и Олвуми Гивой с медицинского факультета Азриэли в Университете Бар-Илан, знаменует собой значительный шаг в продвижении понимания химерных генов и поддержке ученых и врачей в их стремлении разработать более эффективные и персонализированные методы лечения рака . Статья опубликована в журнале Nucleic Acids Research .
Слияния генов, которые происходят при объединении сегментов разных генов , являются генетическим явлением, оказывающим большое влияние на развитие раковых опухолей. Эти изменения иногда приводят к образованию аномальных белков, которые являются важными индикаторами для диагностики заболеваний и потенциальными целями для разработки новых лекарств. База данных ChiTaRS 8.0 содержит более 47 000 транскриптов РНК и более 100 000 химерных последовательностей, идентифицированных у людей.
База данных интегрируется с моделью «цифровой больницы», что позволяет обновлять данные в режиме реального времени и включать новые клинические данные. Эта функциональность предоставляет врачам уникальный инструмент для разработки персонализированных методов лечения онкологических больных на основе их генетического профиля.
Более того, ChiTaRS 8.0 является новаторским инструментом для разработки новых лекарственных препаратов; интеграция данных из базы данных DGIdb позволяет изучать совместимость белков слияния с существующими методами лечения, такими как ингибиторы белков , воздействующие на белки, способствующие развитию рака в организме человека.
Директор Института синтетической биологии им. Скоена при Университете Райхмана, профессор Йоси Шахам-Диаманд поясняет: «База данных также была разработана как инструмент для прогнозирования чувствительности опухолей к лечению, что может повысить успешность лечения и свести к минимуму побочные эффекты. Помимо своего вклада в мировые исследования, ChiTaRS 8.0 призван способствовать сотрудничеству между исследователями и институтами по всему миру, и в будущем планируется включить в нее сложные наборы данных и возможности искусственного интеллекта».
Доктор Френкель-Моргенштерн говорит: «Эта база данных знаменует собой значительный шаг вперед в понимании и лечении рака. Она служит динамичным исследовательским инструментом, призванным изменить облик диагностики и лечения рака . Мы планируем добавить соответствующую информацию об одобренных FDA препаратах, которые могут связывать химерные белки, а также об уровнях экспрессии химерных генов для разработки специализированных биомаркеров для прецизионной медицины».