Исследователи из Института иммунотерапии имени Лейбница (LIT) описывают новый тип регуляции иммунных клеток с помощью так называемых «прыгающих генов».

Иммунная система защищает организм от вторжения бактерий и вирусов, а также от распространения опухолевых клеток. К сожалению, необходимый иммунный ответ организма вызывает нежелательные повреждения, которые организм должен исцелить.

После борьбы с этими опасностями иммунная система должна быть снова ослаблена, в противном случае может возникнуть постоянное воспаление или даже развитие аутоиммунного заболевания. Снижение иммунного ответа и начало заживления тканей частично достигается иммунными клетками , находящимися в тканях , в частности регуляторными Т-клетками. Однако пока недостаточно изучено, чем иммунные клетки, находящиеся в тканях, отличаются от иммунных клеток в крови и подвергаются ли различные типы иммунных клеток в тканях общим программам адаптации.

Исследователи из LIT из Отделения иммунологии эпигенетически исследовали ДНК иммунных клеток, находящихся в тканях, из разных органов. Эпигенетика описывает, как гены могут включаться и выключаться подобно выключателю света, чтобы гарантировать, что клетки развиваются по-разному. Важным аспектом эпигенетики является регулирование так называемых усилителей, доступных сегментов ДНК, которые влияют на экспрессию генов.

«Удивительно, но мы обнаружили удивительно похожие эпигенетически контролируемые программы адаптации в различных типах иммунных клеток в тканях. Это открытие предполагает наличие механизмов регуляции генов более высокого уровня», — объясняет доктор Филипп Штюве, один из первых авторов исследования.

«В ходе поиска этих механизмов регуляции генов более высокого уровня мы обнаружили обогащение так называемых транспозонов или прыгающих генов в эпигенетически доступных областях ДНК», — говорит доктор Лиза Шмидлейтнер, один из первых авторов исследования.

Гены-прыгуны были включены в геном из вирусов и оставили тысячи копий в разных местах генома в ходе эволюции посредством спонтанной интеграции в геном («прыжки»). В результате они теперь составляют почти 50% человеческой ДНК. Долгое время считалось, что эти гены-прыгуны не имеют никакой функции. Несмотря на то, что большинство генов-прыгунов сегодня уже не мобильны, недавние исследования показали, что они играют важную роль в регуляции генов.

«Наши данные показывают обогащение определенных семейств прыгающих генов в иммунных клетках, находящихся в тканях, в доступных регионах энхансеров, что может регулировать тканевую адаптацию иммунных клеток. Кроме того, эти прыгающие гены имеют мотивы для участков связывания так называемых факторов транскрипции, которые важны для функционирования энхансеров», — объясняет доктор Мальте Саймон, один из первых авторов исследования.

Таким образом, прыгающие гены представляют собой ранее недооцененный тип регуляции генов , который мог бы объяснить общие адаптивные программы, которые различные иммунные клетки проходят в процессе развития от крови до функциональных иммунных клеток, резидентных в тканях. Теперь необходимы дальнейшие исследования, чтобы лучше понять эту новую область тканевой иммунологии.

«Всестороннее понимание иммунной системы в тканях является предпосылкой для тканеспецифических подходов к лечению с целью лечения воспалительных или опухолевых заболеваний с помощью генетически улучшенных иммунных клеток», — объясняет профессор Маркус Фойерер, ведущий автор исследования.